董昂¹ , 赵国淼¹ , 胡欢欢¹ , 陈文充¹ , 叶生月² , 曾燕如^1*

1 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室, 临安, 311300; 2 桐庐县农业产业化办公室, 桐庐, 311500
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2017年09月27日    接受日期: 2017年10月27日    发表日期: 2018年08月01日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

推荐引用：

：Dong A., Zhao G.M., Hu H.H., Chen W.C., Ye S.Y., and Zeng Y.R., 2018, Preliminary analysis of transcriptome of hickory(Carya cathayensis) seed in growth and development process, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(12): 3844-3854 (董昂, 赵国淼, 胡欢欢, 陈文充, 叶生月, 曾燕如, 2018, 山核桃(Carya cathayensis)种子生长发育过程转录组的初步分析, 分子植物育种, 16(12): 3844-3854)

山核桃(Carya cathayensis)是浙江省重要的经济树种，其种子脂类含量极高，达 69.80%~74.01%。本研究采用 Illumina HiSeqTM 2000 高通量测序技术对高油种子生长发育过程(6 个时间点)采集的种胚及胚乳进行转录组分析，经组装拼接共获得 Unigene 110 959 条，占总转录本数的 53.93%，并有 39560 个 Unigene至少在 7 个数据库中的一个数据库中获得注释。这些注释的基因 GO 分类共涉及 47 个生物学功能，KOG 分类成 26 组，KEGG 代谢通路分成 5 个分支。基因差异表达分析表明，胚乳在种子生长发育被吸收的过程中基因表达量不低，上下调基因数均是先增加后减少，而同一时间点上下调胚与胚乳差异表达基因(DEG)数均逐渐增加。DEG 聚类分界点在 7~8 月之间。初步发现山核桃种子生长发育过程涉及脂类合成的途径 21 个，相关基因 571 个。这些结果为山核桃日后成油机理的研究打下了基础。

山核桃； 种子； 转录组； RNA-seq； 基因注释